Muzeu paraqet historinë e Sofjes dhe rajonit të saj nga antikiteti deri në shekullin e 20-të, me fokus në jetën e përditshme urbane. Ai ruan koleksione arkeologjike, etnografike dhe të historisë ushtarake, duke plotësuar Muzeun Historik Kombëtar me fokus në identitetin e kryeqytetit.